El servicio de bioinformática marina permite a los usuarios analizar datos ómicos (metagenómica, metatranscriptómica, metabarcoding, etc.) en un clúster de computación de alto rendimiento. MARBITS es la plataforma principal del servicio. Tiene un total de 396 núcleos de cómputo (CPU; 792 con hyperthreading), 4,6 T de RAM y 830 T de almacenamiento compartido. Dependiendo de sus necesidades, los usuarios reciben cuotas de almacenamiento, cálculo y uso de RAM. Los parámetros anteriores son monitoreados para registrar el uso que hacen de la infraestructura, el cual se factura de manera regular.
El servicio cuenta con un técnico en bioinformática que trabaja como administrador del sistema, y también realiza formaciones a los usuarios. Además, el servicio gestiona usuarios, grupos de usuarios y sus permisos asociados e instala y gestiona software de terceros y bases de datos biológicas.
También se proporciona una copia de seguridad de los datos del usuario, aunque el usuario sigue siendo responsable de mantener una copia de seguridad ex situ. El servicio asesora a los usuarios sobre cómo cargar y almacenar datos en repositorios públicos, como ENA o NCBI, y ofrece una formación básica en entornos informáticos UNIX, así como en diversas aplicaciones de biología computacional. También desarrolla pequeñas piezas de software personalizado y flujos de trabajo de bioinformática. La plataforma aconseja además sobre el desarrollo de planes de gestión de datos (DMPs por sus siglas en inglés) que se adhieren a los lineamientos “FAIR”, tal como es requerido por la normativa Europea y Española sobre “Ciencia Abierta”.
El servicio es utilizado por una amplia comunidad científica, con más de 40 investigadores de distintos países.
- Clúster de computación de Alto Rendimiento (HPC). Un nodo master/login (servidor Fujitsu Primergy RX2530 M2) y 22 nodos de cálculo de alto rendimiento con un total de 396 núcleos físicos y 4.6 T de RAM (10 x Supermicro, 12 x IBM iDataPlex). Cuenta con 830 T de almacenamiento en un sistema de ficheros en paralelo y distribuido.
- 3 estaciones de trabajo DELL: Servidores DELL PowerEdge T710 con 2 procesadores Intel Xeon de 4 núcleos (E5620), 16-60 G de RAM y un disco duro de 2T.